Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms