Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefmP08553 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefmP08553 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefmP08553 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NefmP08553 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NefmP08553 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NefmP08553 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NefmP08553 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefmP08553 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefmP08553 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms