Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtssO70370 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtssO70370 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtssO70370 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms