Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pja1O55176 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms