Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LatO54957 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LatO54957 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LatO54957 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LatO54957 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LatO54957 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LatO54957 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LatO54957 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LatO54957 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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