Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbrO54799 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms