Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffaO54786 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffaO54786 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffaO54786 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms