Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Klf9O35739 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms