Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc1O35379 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc1O35379 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms