Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna6O35345 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms