Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr1aO35134 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1aO35134 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms