Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm3542K7N6U2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3542K7N6U2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3542K7N6U2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3542K7N6U2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3542K7N6U2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3542K7N6U2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3542K7N6U2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms