Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms