Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5849J3QPE5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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