Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm8356J3QPD3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm8356J3QPD3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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