Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10428J3QNV7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms