Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm3415J3QMS8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm3415J3QMS8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm3415J3QMS8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm3415J3QMS8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm3415J3QMS8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm3415J3QMS8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm3415J3QMS8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm3415J3QMS8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3415J3QMS8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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