Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r39G3UWE6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms