Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm8005F6YKY3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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