Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aknad1E9Q8N6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aknad1E9Q8N6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms