Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zfp558E9Q1J0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp558E9Q1J0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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