Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc13D3YV10 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms