Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna7C0LLJ0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms