Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2012B1B0R1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2012B1B0R1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms