Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms