Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calcoco2A2A6M5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calcoco2A2A6M5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms