Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdac5Q9Z2V6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms