Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd1Q9Z2E2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd1Q9Z2E2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms