Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uso1Q9Z1Z0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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