Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms