Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ccl8Q9Z121 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl8Q9Z121 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccl8Q9Z121 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccl8Q9Z121 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccl8Q9Z121 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccl8Q9Z121 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccl8Q9Z121 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl8Q9Z121 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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