Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod1Q9R0E2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod1Q9R0E2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms