Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VapbQ9QY76 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VapbQ9QY76 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VapbQ9QY76 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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VapbQ9QY76 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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VapbQ9QY76 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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VapbQ9QY76 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VapbQ9QY76 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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