Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms