Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx8Q9QXV1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms