Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Reep6Q9JM62 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Reep6Q9JM62 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms