Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col5a3Q9JLI2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms