Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF1

Gabrq, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrqQ9JLF1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabrqQ9JLF1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GabrqQ9JLF1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms