Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pole3Q9JKP7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms