Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpf2Q9JJ80 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpf2Q9JJ80 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms