Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpgrip1Q9EPQ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms