Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenooQ9DBC0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms