Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot8Q9D8X5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms