Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Borcs6Q9D6W8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms