Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rabl3Q9D4V7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms