Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms