Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms