Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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