Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms