Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q99KU6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q99KU6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q99KU6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q99KU6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms